Service de Microbiologie

Présentation

Unité de Bactériologie
– Composée de 3 axes :la culture, la sérologie et la biologie moléculaire,  la plupart des analyses des examens de bactériologie est prise en charge par de la robotique.
Des diagnostics non conventionnels de biologie moléculaire (PCR universelles ADNr16S et 18S par exemple), réalisés dans un nombre restreint de laboratoires, sont effectués pour le groupe hospitalier et d’autres établissements de santé.
Le laboratoire d’hygiène  assure l’analyse des échantillons concernant la surveillance microbiologique de l’environnement (air, eaux, surfaces) et des surfaces dans les zones à risques (blocs opératoires, etc.). Il prend en charge les échantillons de dépistage de Bactéries Multi- et/ou Hautement- Résistantes aux antibiotiques (BMR/BHR) issus des patients.
– Le laboratoire produit annuellement des données sur l’écologie de la résistance bactériennes aux antibiotiques participe à la surveillance des infections nosocomiales.
Unité de Virologie

• Composée de  trois secteurs

–culture cellulaire : Isolement viral
–sérologies virales
–virologie moléculaire

• L’activité de virologie médicale comprend des examens:
  • de virologie transversale

de proximité (bilans d’entrée, bilans pré-chirurgicaux, médecine interne, urgences, gestion des accidents d’exposition au sang pour le personnel d’un hôpital de 860 lits, …) impliquant des actes de biologie normative et non spécialisée, notamment en sérologie virale et en diagnostic moléculaire rapide (grippe par exemple) ;

• de virologie spécialisée

en immunologie clinique (monitoring des malades infectés par le VIH, y compris les infections hépatiques)
dans le domaine des infections virales respiratoires (urgence, réanimations)
en oncologie virale, dans le contexte plus général de la prise en charge intégrée multidisciplinaire des cancers et conditions pré-cancéreuses associés aux HPV.

Unité de Parasitologie-Mycologie
–Assure le diagnostic des parasitoses et des mycoses invasives et superficielles. La démarche diagnostique repose sur la recherche directe, les techniques sérologiques, l’identification des champignons en culture et la détermination de la sensibilité aux antifongiques.
–Assure l’interprétation des résultats auprès des cliniciens et participent aux conseils diagnostiques et thérapeutiques en collaboration avec l’unité Mobile de Microbiologie Clinique.
 
L'unité mobile de microbiologie clinique assure le conseil antibiotiques et le diagnostic des maladies infectieuses. Elle dispose d'une consultation d'infectieux (Pr Jean Luc Mainardi) avec une spécialisation sur les endocardites.